非织造材料后整理抗菌技术差异很大，应用要求也完全不同，根据抗菌技术、产品最终用途和抗菌剂的作用机理，可选择各种不同的应用方法和步骤，如在聚合物熔体中、在纤维加工过程中加入抗菌剂，或对织物或产品进行后整理。在聚合物成纤后，抗菌剂可加到拉伸油剂和纺纱油剂中，需要注意的是要解决抗菌剂和油剂相容性和均匀性能的问题以及保持纺丝整理的性能。
抗菌整理可以在拉伸工序后的每一道工序中进行，在有卷曲油剂或无卷曲油剂时都可在卷曲工序中加入抗菌剂，利用热定型工艺保证抗菌剂能永久粘合在纤维表面。在使用AEM5700／5772活性硅烷抗菌剂时，需进行粘合反应，以提高抗菌效果的耐久性。一些可以与纤维进行反应或粘合在纤维上的抗菌剂可加入到纺粘非织造布产品中，通过喷雾或浸轧粘合在纤维网上。这些操作可在纤维生产厂或在预处理阶段完成。该方法可以在纤维表面进行抗菌处理，同时也可提供加工过程和最终产品所需的相容性和安全性。如果要将抗菌剂加在最后的非织造布衬底表面上，这可以用喷雾技术和浸轧工艺完成。
此外，在聚合物熔体中加入抗菌剂，必须评估聚合物熔融时所产生的一些问题。例如，抗菌剂如何均匀地混入聚合物中；在230℃温度下加工2min～3min，对于可能产生的抗菌剂挥发、纤维性能改变、对颜色或反射率产生负效应、过滤器堵塞以及加工的纤维出现发臭、雾化、粉化或表面盐析化等问题如何解决。此外，还需要考虑抗菌剂是否会影响生产线上的工人和消费者的健康、会不会污染环境。
